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【长江日报】填补空白!水生所联合华大揭示四大家鱼之鲢鳙进化史

  长江日报-长江网12月9日讯(记者陈洁 通讯员孙慧)日前,总站|金沙集团1755app下载研究所何舜平研究员团队联合华大基因等多家单位在英国期刊《Molecular Ecology Resources》在线发表研究论文。该研究利用短读长测序技术,结合遗传图谱辅助挂载染色体的组装策略,获得连续性较好、准确度高的染色体水平的鲢鱼和鳙鱼基因组,同时对鲢鱼20个野生样本(珠江7个,黑龙江4个,长江9个),鳙鱼22个野生样本(珠江8个,黑龙江4个,长江10个)进行群体重测序分析,揭示了东亚鲤科鱼类的进化历史,并进一步探讨了鲢鱼、鳙鱼物种形成和群体分化的遗传学基础。

   

  研究人员介绍,四大家鱼(青鱼、草鱼、鲢鱼和鳙鱼)由于栖息习性不同,能充分利用整个生活空间的天然饵料和水域分层,互不干扰,很适合混养在一个池塘里,同时具有生长快、产量高等优势,因此成为我国传统的养殖鱼类。直到今天,这四种鱼仍是我国乃至全世界淡水养鱼的主体鱼,每年产量占我国淡水养殖鱼类的一半以上。

  然而这些统称亚洲鲤的鱼类作为中国畅销美食的同时,在美国却泛滥成灾。上个世纪70年代,美国很多水域都会出现杂草和寄生虫,便从我国引进了不少鲢鱼、鳙鱼等来解决这些麻烦,但是由于没有天敌,又不是当地的食用鱼类,演变成入侵物种泛滥成灾。

  鲢鱼、鳙鱼是典型的东亚特有鲤科鱼类,是我国最大的经济鱼类养殖群体,为我国提供了大量的优质水产蛋白资源。何舜平研究员团队联合华大基因等多家单位发表的论文,结合短读长组装和群体重测序技术,研究了鲢鱼、鳙鱼两个基因组和多个野生群体,重点关注东亚鲤科鱼类的进化历史与染色体改变、物种形成与群体多样性、基因功能与环境适应等内容。该研究具有重要的意义,不但对鲢鱼和鳙鱼的基因组进行了高质量的测序组装,并为新品种开发打下坚实基础,对全国各大水系的鲢鱼和鳙鱼开展了比较种群基因组学研究, 为遗传育种提供丰富的种质资源数据,而且也为物种形成、分化、环境适应及物种入侵的科学研究提供参考模型。

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